广州南沙游艇俱乐部码头工程位于广州南沙开发区东部，虎门大桥下游200~800米处。施工期，基槽开挖和港池疏浚产生的悬浮泥沙、施工船舶含油污水、施工人员生活污水和生活垃圾等会对环境产生一定影响；营运期，污染源主要来自于游艇俱乐部生活污水、生活垃圾和船舶含油污水。
采用挖入式港池布置，并预留防波堤外侧未来建设港区公共泊位的空间。拟建游艇泊位317个，其中36英尺以下泊位34个，36~60英尺泊位263个，大于60英尺泊位20个，占总泊位比例分别为11%，83%和6%。此外，另设55个摩托艇泊位。主要结构包括游艇泊位、水上平台、栈桥、防波堤、内护岸、挡土墙、上下岸坡道、提升机承台等。
本工程的疏浚包括防波堤以内的港池航道海域、码头栈桥海域，疏浚工程量为37.0万m3。同时，有2.6659公顷的陆域将开挖为海域。工程建设后，改变了工程区域的水下地形和岸线形状，进而改变水动力环境。从模拟计算结果看，工程建设后对水动力影响非常小，这与工程所处位置有关。填海顺岸而填，面积很小；临时防波堤虽然是非透水构筑物，但面积也很小；挖入式港池处于岸线凹入处，本身水动力很弱；南、北防波堤为透水构筑物，对水动力影响小。因此，整个项目对水动力影响很小。
工程完成后，港池内水深增加，港池外防波堤使得到达此处的波浪耗散能力有所减少，防波堤前波浪将略有增大。由于虎门口总体波浪强度不大，因此局部波高略有加大基本不会影响邻近海岸波浪动力环境。
